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Projekte

PROJEKTE IM TRAIN-VERBUND

Im Folgenden werden verschiedene translationale Forschungsprojekte vorgestellt, an denen mehrere TRAIN-Partnereinrichtungen beteiligt sind. Diese Projekte wurden von TRAIN initiiert, werden aktuell mitkoordiniert oder sind bereits abgeschlossen. Darüber hinaus werden Initiativen und Projekte aufgeführt, die im Rahmen von TRAIN-Veranstaltungen entstanden und eng mit TRAIN und TRAIN Omics assoziiert sind.

Alle diese hier dargestellten Projekte verbindet die gemeinsame Nutzung von Infrastrukturen der TRAIN‑Partnereinrichtungen sowie des TRAIN‑Netzwerks und die Förderung der Weiterentwicklung dieser Infrastrukturen. Die Forschungsprojekte sind zentrums‑ und disziplinübergreifend und basieren auf einer engen und bereichsübergreifenden Zusammenarbeit.

ExTENd – Expertise & Technology Exchange Niedersachsen

Eine geplante digitale Plattform für Technologie, Infrastruktur und Expertise in der niedersächsischen Gesundheitsforschung

 

Mit ExTENd – Expertise & Technology Exchange Niedersachsen bereitet TRAIN gemeinsam mit Partnern den Aufbau einer zentralen digitalen Plattform vor, die Forschende in Niedersachsen in Zukunft einfacher mit hochspezialisierten Technologien, wissenschaftlicher Expertise und methodischer Beratung vernetzen soll. Ausgangspunkt ist der Bereich der Omics-Technologien – darunter Genomik, Transkriptomik, Proteomik und Metabolomik – ergänzt durch Bioinformatik, Datenanalyse und Datenmanagement. Die Umsetzung ist Gegenstand eines eingereichten Förderantrags.

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ExTENd auf einen Blick

Name: Expertise & Technology Exchange Niedersachsen (ExTENd)
Ziel: Zentrale digitale Plattform für wissenschaftliche Expertise, Technologieinfrastruktur, Software und Services
Pilotbereich: Omics-Technologien inkl. Bioinformatik, Datenanalyse und Datenmanagement
Partnerstrukturen:
TRAIN-Partnerinstitutionen, TRAIN Omics, Niedersachsen.next und innomatch
Geplanter Nutzen:
Bessere Auffindbarkeit und Zugänglichkeit von Technologien, Dateninfrastruktur und Expertise, strukturierte Kontaktaufnahme, effizientere Nutzung vorhandener Infrastruktur, Stärkung standortübergreifender Kooperationen sowie Förderung von Exzellenz, Innovation und Standortattraktivität
Status: Förderantrag eingereicht; Umsetzung vorbehaltlich positiver Förderentscheidung
Perspektive: Erweiterung auf weitere High-End-Technologiebereiche sowie Weiterbildungs- und Transferexpertise in Niedersachsen möglich

Moderne biomedizinische Forschung ist zunehmend auf komplexe Technologien, leistungsfähige Dateninfrastrukturen und standortübergreifende Zusammenarbeit angewiesen. ExTENd – Expertise & Technology Exchange Niedersachsen soll hierfür einen zentralen digitalen Einstiegspunkt schaffen: Forschungsinfrastruktur, Software, Services, Analyseverfahren und wissenschaftliche Expertise sollen in Niedersachsen sichtbar, auffindbar und leichter zugänglich werden.

TRAIN Omics vernetzt Forschungseinrichtungen, Omics-Technologieplattformen sowie Expertinnen und Experten aus Medizin, Naturwissenschaften, Bioinformatik und Datenwissenschaften. Die Initiative knüpft an die bisherigen Aktivitäten von TRAIN Omics an. ExTENd soll diese Vernetzung in eine strukturierte digitale Infrastruktur überführen mit dem Omics-Bereich als ersten Anwendungsfall.

Zentrale Ziele von ExTENd

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Entstehung einer digitale Plattform, die Technologien, Services, Softwarelösungen, Analyseverfahren und methodische Expertise strukturiert erfasst und durchsuchbar macht. 

Betrachtung (steuer-)rechtlicher und organisatorischer Rahmenbedingungen für die gemeinsame Nutzung von Infrastruktur über Institutionsgrenzen hinweg und Identifizierung bestehender Hürden. Entwicklung von Lösungen für Kontaktwege, Nutzungsbedingungen, Verantwortlichkeiten und perspektivisch harmonisierte Zugangsprozesse. 

Erstellung einer zentralen Landingpage als One-Stop Shop, über die Nutzer:innen passende Technologien, Services und Ansprechpartner:innen finden, Kontakt aufnehmen und perspektivisch strukturierte Anfragen oder Buchungsprozesse starten können.

Antragstellende Einrichtungen bei ExTENd:

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Assoziierte Partnereinrichtungen bei ExTENd:

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Die Plattform soll in enger Zusammenarbeit mit Niedersachsen.next entwickelt und an bestehende digitale Strukturen des niedersächsischen Innovationsökosystems angebunden werden. Dabei kann innomatch, die von Niedersachsen.next betriebene Plattform zur Vernetzung von Start-ups, Unternehmen, Forschung und Transferakteuren, als technische und strukturelle Grundlage dienen. So soll ExTENd wissenschaftliche Infrastruktur- und Expertiseübersichten mit innovations- und transferorientierten Angeboten in Niedersachsen verbinden.

Langfristig ist ExTENd als skalierbares Modell gedacht. Nach einem erfolgreichen Omics-Piloten könnte die Plattform schrittweise auf weitere technologieintensive Bereiche ausgeweitet werden, etwa Bildgebung, präklinische Modelle, Strukturbiochemie, alternative Methoden, computergestützte Analysen oder transferorientierte Services.

Der Aufbau von ExTENd wird derzeit vorbereitet. Die Umsetzung soll vorbehaltlich der weiteren Förderentscheidung erfolgen.

MoReHealth Niedersachsen 

A Best Practice for Standardized Multi-omics Health Research in Personalized Medicine in Lower Saxony 

 

MoReHealth Niedersachsen ist ein Verbundprojekt zur personalisierten Medizin in Niedersachsen. Ziel des Projekts ist es, am Beispiel altersabhängiger Infektionsanfälligkeit eine standardisierte Multi-Omics-basierte Daten- und Analyseinfrastruktur aufzubauen, die künftig als Prototyp für eine landesweite molekulare Forschungsdateninfrastruktur in der personalisierten Medizin dienen kann. 

Im Mittelpunkt steht die wissenschaftliche Frage, wie sich individuelle molekulare Profile nutzen lassen, um Risiken, Krankheitsverläufe sowie mögliche Präventions- und Therapieansätze bei infektiologischen Erkrankungen besser zu verstehen. Als konkreter medizinischer Use Case wird die altersabhängige Anfälligkeit gegenüber Herpesvirus-Infektionen untersucht, insbesondere gegenüber dem Varizella-Zoster-Virus und schweren Verläufen von Herpes Zoster (Gürtelrose). 

Das Projekt verbindet klinische Kohorten, Biobanking, Multi-Omics-Technologien, Bioinformatik, Datenmanagement und KI-gestützte Analysen. Damit adressiert MoReHealth eine zentrale Herausforderung der personalisierten Medizin: die qualitätsgesicherte, standardisierte und interoperable Nutzung komplexer molekularer, funktioneller und klinischer Daten für Forschung, Prävention, Diagnostik und Therapie. 

MoReHealth ist auf Initiative von TRAIN – Translationsallianz in Niedersachsen und dem Exzellenzcluster RESIST entstanden und stärkt die translationale Gesundheitsforschung im Raum Hannover–Braunschweig–Göttingen. 

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MoReHealth Niedersachsen auf einen Blick

Projektlaufzeit: 09/2025 – 08/2029 
Gesamtfördersumme:
 ca. 3 Mio. Euro 
Förderlinie:
 „Neue Fragestellungen der personalisierten Medizin in Prävention, Diagnostik oder Therapie“ 
Förderung:
 zukunft.niedersachsen — ein gemeinsames Förderprogramm des Niedersächsischen Ministeriums für Wissenschaft und Kultur und der VolkswagenStiftung 

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Zentrale Ziele von MoReHealth Niedersachsen

  • Zunächst werden bestehende Datensätze der RESIST Senior Individuals-Kohorte erweitert und vervollständigt. Dazu gehören hochdimensionale DurchflusszytometrieTranskriptomdaten und Zytokinmessungen. Zusätzlich werden neueste Technologien wie Long-Read-Genomsequenzierung, mtDNA-Sequenzierung und quantitative Metabolomik auf ausgewählte Proben angewendet. 

    Ein besonderer Fokus liegt auf der Qualitätssicherung entlang der gesamten Prozesskette — von der Probenverarbeitung über die Datenerhebung bis zur Analyse. Hierfür werden standardisierte Workflows, SOPs und qualitätsgesicherte Prozesse etabliert. 

  • Im Rahmen von MoReHealth wird eine skalierbare, sichere und DSGVO-konforme Multi-Omics-Datenplattform. Sie soll klinische, molekulare, funktionelle und Omics-Daten strukturiert zusammenführen und über definierte Governance-, Metadaten- und Zugriffsprozesse nutzbar machen. 

    Die Plattform wird zunächst für die Daten der RESIST Senior Individuals-Kohorte aufgebaut. Perspektivisch soll sie als Prototyp für ein molekulares Gesundheitsdaten-Repository in Niedersachsen dienen und für weitere Projekte und Krankheitsbereiche erweiterbar sein. 

  • Hierbei steht die Entwicklung und Nutzung KI-basierter Analysewerkzeuge zur Integration einzelner und mehrerer Omics-Ebenen im Vordergrund. Ziel ist es, diagnostische und prognostische Biomarker für schwere Herpes-Zoster-Verläufe zu identifizieren und molekulare Netzwerke zu entschlüsseln, die zur Krankheitsentstehung und zu Komplikationen beitragen. 

    Durch KI-gestützte Netzwerk- und Biomarkeranalysen sollen molekulare Signaturen, pathophysiologische Mechanismen und potenziell therapeutisch adressierbare Zielstrukturen sichtbar gemacht werden. 

Der Norddeutsche Rundfunk (NDR) hat einen Videobeitrag zu MoReHealth Niedersachsen erstellt. 

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Konsortium

Medizinische Hochschule Hannover, Hannover Biobank 

Prof. Dr. Thomas Illig (Projektleiter & Sprecher des Steering Committee) 

Dr. Sara Haag (Leitung Projektmanagement) 

Dr. Markus Kersting 

Medizinische Hochschule Hannover, Institut für Immunologie 

Prof. Dr. Reinhold Förster (stellvertretender Sprecher des Steering Committee) 

Prof. Dr. Sarina Ravens 

Medizinische Hochschule Hannover, Klinik für Dermatologie, Allergologie und Venerologie

Dr. Lennart Rösner 

Prof. Dr. Thomas Werfel 

Peter L. Reichertz Institut für Medizinische Informatik

Prof. Dr. Helena Zacharias 

Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung, Experimentelle Immunologie 

Prof. Dr. Jochen Hühn 

Technische Universität Braunschweig, Braunschweig Integrated Centre of Systems Biology (BRICS)

Prof. Dr. Thekla Cordes 

Prof. Dr. Karsten Hiller 

Universitätsmedizin Göttingen, Institut für Humangenetik 

Dr. Julia Schmidt 

Prof. Dr. Bernd Wollnik 

Physikalisch-Technische Bundesanstalt, Fachbereich Biochemie (Assoziierter Partner) 

Prof. Dr. Gavin O’Connor  

Ansprechpartnerin: 

Dr. Sara Haag, TRAIN – Translationsallianz in Niedersachsen 

Kontakt: sara.haag@translationsallianz.de

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ImProVIT (2019 – 2022)

Transforming big data into knowledge: for deep immunoprofiling in vaccination, infectious diseases and transplantation

 

Das Immunsystem ist zentral für Gesundheit und Krankheit, doch die verfügbaren Immun‑Monitoring‑Techniken (v. a. FACS‑basierte Analyse von PBMC) sind teuer, zeitaufwendig, schlecht reproduzierbar und liefern vor allem Verteilungsdaten – kaum funktionelle Informationen.

ImProVIT schafft hier ein wissensbasiertes Framework, das heterogene Datensätze aus konventionellen Durchflusszytometrien (FACS) und innovativen Verfahren (Chip‑Zytometrie, T‑/B‑Zell‑Rezeptor‑Repertoire, Einzelzell‑Analyse, Zytokin‑Array, Transkriptomik, Whole‑Genome‑Sequenzierung) standardisiert integriert. Diese Daten werden in einem Wissensgraphen zusammengeführt, der durch biomedizinische Ontologien (HPO, OMIM) angereichert ist und so das humane Immunsystem unter Homöostase, nach Impfung, Infektion oder Transplantation abbildet.

Mithilfe von Wissensmanagement und Pattern‑Discovery‑Methoden können Forscher:innen neue immunologische Muster erkennen, charakterisieren und erforschen. Ziel ist ein optimiertes Immunprofiling, das Diagnostik verbessert, Therapien individualisiert und die Entwicklung neuer Impfstoffe beschleunigt.

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ImProVIT auf einen Blick

Ziel: Ein ganzheitliches Verständnis des menschlichen Immunsystems im gesunden und im erkrankten Zustand

Methodik: 

  • Integration von Immunmonitoring-Daten mit Informationen aus Open-Source-Datenbanken und Ontologien zur Schaffung eines wissensbasierten Rahmens
  • Erstellung und Überprüfung von Vorhersagen (z. B. Impfstoffansprechbarkeit, Transplantatabstoßung oder -toleranz)

Projektlaufzeit: 10/2019 – 09/2022 
Gesamtfördersumme:
 ca. 1,1 Mio. Euro 
Förderlinie:
Big Data in den Lebenswissenschaften der Zukunft

Förderung: zukunft.niedersachsen — ein gemeinsames Förderprogramm des Niedersächsischen Ministeriums für Wissenschaft und Kultur und der VolkswagenStiftung 

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Das interdisziplinäre Konsortium aus Immunologen, Klinikern und Datenwissenschaftlern entwickelte eine Methodik zur Bestimmung des Immunstatus von Patient:innen. Zu diesem Zweck wurden Protokolle zur Immunüberwachung erstellt und die gewonnenen Daten mit anderen klinischen Daten derselben Patient:innen sowie mit Informationen aus verschiedenen biomedizinischen Datenbanken kombiniert.

Die kombinierten Daten dienten als Grundlage für die Erstellung eines sogenannten Wissensgraphen, der zu einem besseren Verständnis des menschlichen Immunsystems beitrug. Darüber hinaus bildete der Wissensgraph die Grundlage für die Vorhersage von Reaktionen auf neue Impfstoffe, für die Bestimmung von Biomarkern für Transplantatabstoßung oder -toleranz und trug dazu bei, den Verlauf und den Ausgang von Infektionskrankheiten vorherzusagen. Der Wissensgraph wurde kontinuierlich durch neue Daten erweitert, die mit einer Vielzahl immunologischer Methoden generiert wurden. Ziel war es, das Wissen über das menschliche Immunsystem kontinuierlich zu erweitern und das Immunmonitoring als standardisierte Methode zu etablieren, um Informationen über den Immunstatus jeder Patientin und jedes Patienten zu liefern.

Dieses Wissen wird dazu beitragen, optimierte Behandlungsoptionen für Patient:innen zu entwickeln und die neu gewonnenen Erkenntnisse als Grundlage für die Entwicklung neuer Interventionsstrategien und Impfstoffe zu nutzen.

Konsortium

TWINCORE Zentrum für Experimentelle und Klinische Infektionsforschung GmbH

Prof. Dr. Ulrich Kalinke 

Technische Informationsbibliothek (TIB)

Prof. Dr. Maria-Esther Vidal

Medizinische Hochschule Hannover (MHH)

Prof. Dr. Christine Susanne Falk

Medizinische Hochschule Hannover (MHH)

Prof. Dr. Markus Cornberg

TWINCORE Zentrum für Experimentelle und Klinische Infektionsforschung GmbH

PD Dr. Frank Pessler

Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung (HZI)

Prof. Dr. Carlos Alberto Guzmán
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INDIRA (2019 – 2022)

INtegrative Data analytIcs for Respiratory syncytiAl virus RIsk Assessment

 

Das Respiratorische Synzytial-Virus (RSV) ist die häufigste Ursache für Infektionen der unteren Atemwege bei Säuglingen. Der Verlauf und der Ausgang einer primären RSV-Infektion sind sehr unterschiedlich und die Faktoren, die einen schweren Krankheitsverlauf bestimmen, sind nur unzureichend bekannt. Zum Schutz von Säuglingen mit sehr hohem Risiko (z. B. aufgrund einer Frühgeburt) wird ein prophylaktischer Antikörper eingesetzt. Da jedoch das Wissen über die Risikofaktoren einer RSV-Infektion lückenhaft ist, können nicht alle bedürftigen Kinder geschützt werden.

Das Ziel von INDIRA ist es, Biomarker zu identifizieren, die eine schwere RSV-Erkrankung vorhersagen und zu verstehen, wie diese den Schweregrad der Erkrankung beeinflussen.

INDIRA integriert umfassende biologische und klinische Datensätze von Patient:innen mit schwerer primärer RSV-Infektion. Mithilfe computergestützter Methoden, einschließlich maschineller Lernverfahren, werden einzelne Marker und Markerkombinationen mit schweren Erkrankungen in Verbindung gebracht und in funktionellen virologischen und immunologischen Experimenten validiert.

INDIRA zielt darauf ab, neue Erkenntnisse über die Determinanten schwerer RSV-Infektionen bei Säuglingen zu gewinnen, um molekulare Diagnostika zu entwickeln, die letztlich eine personalisierte Prophylaxe für die am stärksten gefährdeten Säuglinge ermöglichen.

INDIRA auf einen Blick

Ziel: Entwicklung neuartiger Diagnoseverfahren für Infektionen mit dem Respiratorischen Synzytial-Virus (RSV)

Methodik: 

  • Integration von Multi-Omics-Daten zur Analyse des Verlaufs und des Ausgangs von RSV-Infektionen bei Säuglingen.
  • Identifizierung einer Matrix genetischer und/oder quantitativer Biomarker, die den Schweregrad der Erkrankung vorhersagen

Projektlaufzeit: 09/2019 – 08/2022 
Gesamtfördersumme:
 ca. 1,1 Mio. Euro 
Förderlinie:
Big Data in den Lebenswissenschaften der Zukunft

Förderung: zukunft.niedersachsen — ein gemeinsames Förderprogramm des Niedersächsischen Ministeriums für Wissenschaft und Kultur und der VolkswagenStiftung 

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Konsortium

TWINCORE Zentrum für Experimentelle und Klinische Infektionsforschung GmbH

Prof. Dr. Thomas Pietschmann

Medizinische Hochschule Hannover (MHH)

Prof. Dr. Thomas Illig

Universitätsmedizin Greifswald

Prof. Dr. Lars Kaderali

Gottfried Wilhelm Leibniz Universität Hannover

Prof. Dr. Jörn Ostermann

Gottfried Wilhelm Leibniz Universität Hannover

Prof. Dr. Bodo Rosenhahn

Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung (HZI)

Dr. Robert Geffers 
 

Leibniz-Institut DSMZ-Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH

Prof. Dr. Jörg Overmann

Medizinische Hochschule Hannover (MHH)

Prof. Dr. Gesine Hansen

Technische Universität Braunschweig

Prof. Dr. Karsten Hiller

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FibrOmics (2019 – 2022)

Translating Omics studies into clinically relevant insights for lung fibrosis patients

 

Lungenfibrose verursacht Gesundheitskosten in Höhe von 10 Milliarden Euro und in Europa sind etwa 750.000 Menschen daran erkrankt. Die idiopathische Lungenfibrose (IPF) ist die häufigste Form dieser Erkrankung mit einer geschätzten medianen Überlebenszeit von 3 Jahren und einem variablen Krankheitsverlauf. Die Zahl der Todesfälle aufgrund von Fibrose ist doppelt so hoch wie die durch Krebs. Nach mehr als zwei Jahrzehnten Forschung verlängern die verfügbaren Therapien die mediane Überlebenszeit der behandelten Patient:innen lediglich auf 4,5 bis 5 Jahre. Ein wesentlicher Teil der Geschichte der Arzneimittelentwicklung für IPF ist auf erhebliche Einschränkungen der verfügbaren Modelle zurückzuführen.

Jüngste Fortschritte bei den Technologien zur Einzelzell-RNA-Sequenzierung ermöglichen es Forscher:innen, die zelluläre Aktivität in der fibrotischen Lunge mit beispielloser Detailgenauigkeit zu erfassen. Sie können Subpopulationen von Zellen mittels integrativer computergestützter Analyse untersuchen, um das Verständnis der zugrunde liegenden Mechanismen und Signalwege der IPF zu vertiefen. Durch die Anwendung dieser Daten im Bereich der pharmazeutischen Risikobewertung werden die Krankheitssignaturen zudem die Entwicklung alternativer Methoden zur Gefahrencharakterisierung ermöglichen und dadurch den Bedarf an Tierversuchen verringern.

Angesichts der Komplexität fibrotischer Erkrankungen sowie der technologischen Herausforderungen und Chancen, die sich aus neuartigen Sequenzierungstechnologien ergeben, liegt eine zentrale Stärke dieses Projekts in seinem interdisziplinären Ansatz, der Fachwissen aus Medizin, Biologie und Datenwissenschaft an drei führenden Forschungseinrichtungen in Hannover vereint.

FibrOmics auf einen Blick

Ziel: Verständnis der zugrunde liegenden Mechanismen und Signalwege der Lungenfibrose dank Einzelzell-RNA-Sequenzierungstechnologien

Projektlaufzeit: 10/2019 – 09/2022 
Gesamtfördersumme:
 ca. 1,1 Mio. Euro 
Förderlinie:
Big Data in den Lebenswissenschaften der Zukunft

Förderung: zukunft.niedersachsen — ein gemeinsames Förderprogramm des Niedersächsischen Ministeriums für Wissenschaft und Kultur und der VolkswagenStiftung 

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Konsortium

Medizinische Hochschule Hannover (MHH)

Prof. Dr. David deLuca

Medizinische Hochschule Hannover (MHH)

Prof. Dr. Thomas Illig

Medizinische Hochschule Hannover (MHH)

Prof. Dr. Antje Prasse

Fraunhofer-Institut für Toxikologie und Experimentelle Medizin (ITEM)

Prof. Dr. Sylvia Escher

Stiftung Tierärztliche Hochschule Hannover

Prof. Dr. Klaus Jung
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